La generación de nuevos conocimientos mediante actividades de investigación científica y desarrollo tecnológico constituye una de las funciones básicas de la UNER. En poco más de una década, la Universidad ha construido un sistema científico-tecnológico que incluye alrededor de 400 personas involucradas en ese tipo de tareas, tanto docentes-investigadores como estudiantes de grado, que han llevado a cabo numerosos proyectos volcados a la producción de nuevos conocimientos y su aplicación a la solución de problemas regionales, sociales y de la propia institución.
La Facultad de Ciencias Económicas en su área de Investigación se rige por las ordenanzas establecidas por la Universidad Nacional de Entre Ríos.
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