La Secretaría tiene como objetivo la gestión económica y financiera de la Facultad de acuerdo a las políticas establecidas por el Decano y el Consejo Directivo. Participa en la formulación y coordinación de programas que garanticen la ejecución de fondos en términos de eficiencia, eficacia y economicidad.
Entre sus principales funciones se encuentra las de Programación, ejecución y control presupuestario, Contabilidad y Tesorería, Rendición de Cuentas, Gestión de compras y contrataciones y Gestión Patrimonial, además de asistir y asesorar a las demás secretarías y direcciones en la ejecución de fondos.